PCR實驗室基礎知識
為了對以個特定序列進行PCR做重複檢測,需要三個(gè)不同的區域,每一個(gè)區域的具體技術操作和試劑在下麵詳細列出
1、樣品準備區(qū)
這個區域專門用作樣品的準備,在製備和操作用於核酸提取的試劑時應該采
取預防措施:
1)PCR產物和帶(dài)有要擴增序列(liè)的DNA克隆不能在這個房(fáng)間操(cāo)作。
2)組織培養(yǎng)物、組織標本和血清樣品都(dōu)帶進(jìn)樣品準備間處理,以根據應用的需要提取DNA或RNA。
3)用於樣品處理的工具不能被用(yòng)作普通分子克隆的工具,也不能用作操(cāo)作(zuò)靶(bǎ)序(xù)列。
4)DNA樣品應該用有專門的防護或正壓活塞式移液管操作,以防止(zhǐ)在吸取樣品時有氣溶膠遺留。
5)大體積樣品應該用單獨包裝的無菌一次性移液管吸取。
6)管子打開前都要簡(jiǎn)短離心以減少氣溶膠的產生,而且管子不能用力崩開,這樣會產生氣溶膠。
7)任何時候都應該穿實驗服和帶手套,手(shǒu)套要經常更換,尤其在抽提過程中(zhōng)每一(yī)步之間(jiān)都要更換。實驗服要專門(mén)用於樣品準備間,經(jīng)常清(qīng)洗。
2、樣品準備和(hé)RNA-PCR
RNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品操作,這樣(yàng)增加了樣品之間汙染(rǎn)的機會。
3、前PCR區
必須有專門用於準備各種反應的區(qū)域,這個(gè)區域(yù)必須保持幹淨,而且沒有來(lái)自克隆(lóng)和樣(yàng)品準備的汙(wū)染。前PCR區必須要有試劑和準備(bèi),特別是專門用於前PCR區的正壓活塞式移液管。
4、PCR實驗室試劑的操作
1)所用的所(suǒ)有溶液都應該沒有核酸和(或)核酸(suān)酶(méi)(DNase和(hé)RNase)汙染。
2)所有PCR試劑中使用的水都應該是高質量的-新鮮蒸餾的(de)去離子(zǐ)水,用0.22μm過濾的,並且是高壓滅菌。
3)在20℃到25℃貯存的試劑建議加點像疊氮鈉一類的抗微生物劑,在擴增試劑或(huò)樣品製備試劑中加入0.025%的(de)疊氮鈉不抑製擴(kuò)增反應。
4)所(suǒ)用(yòng)試劑(jì)都應該以大體(tǐ)積配製,實驗一下看試劑是否滿意,然後(hòu)分裝成僅夠(gòu)一(yī)次使用的量進行貯存。
5)所(suǒ)有試劑和樣品(pǐn)準備過程中都要使用一次(cì)性滅菌的瓶子和(hé)管子。
6)新配製的試劑在用(yòng)於準備新的標本之前應該加以(yǐ)檢驗。
7)樣品準(zhǔn)備(bèi)和前PCR區所使用的移液管在不使用時都應該(gāi)小心保存。
5、在前PCR區建立PCR混合物
1)可以把即刻可用的“主混合物”溶液配好(hǎo)、分裝(zhuāng)並保(bǎo)存在-20℃或4℃,在實驗室隻涉及到擴增(zēng)一種或少數幾(jǐ)種特異序列時這樣做很有用。
2)如(rú)果你的實驗(yàn)室使用多套引物,以致於(yú)配製包括所有試劑的單一反應混合物不夠經濟,可以考慮分裝保存夠一天的PCR成分。
3)作為一個規則,應該(gāi)保存一套陰性(xìng)、弱陽性和強陽性對照樣品來分析樣品配(pèi)製(zhì)和PCR前過程的效率和潔淨程度。而且,你也(yě)希望通過使用一個已知的弱陽性樣品來驗證(zhèng)你的樣品緩衝液以證明裏麵不(bú)含擴增抑製物。